扁桃体的内部为淋巴组织，表面被鳞状上皮覆盖。这层鳞状上皮向扁桃体内部凹陷进去，形成扁桃体隐窝。正常情况下，脱落的上皮连同食物残渣，会随着吞咽等动作被唾液冲刷掉，保持局部清洁与动态平衡。当扁桃体有反复慢性炎症时，隐窝处的上皮会出现功能障碍，甚至瘢痕，无法及时有效地清理异物，积聚后进一步滋生细菌，甚至沉积钙磷等矿物质，长此以往就形成了所谓的“结石”。扁桃体结石最常见的症状就是口臭，因为结石中有厌氧菌感染；有些患者会闻到类似于蛋白质腐败的腥臭味。严重时，还可观察到扁桃体上有白色东西附着。（@生命时报）
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